C’est Napoléon qui en 1799 introduisit à Berne la liberté de religion, ce qui marqua le début du catholicisme d’après Réforme à Berne. De plus en plus de catholiques vinrent s’installer à Berne, notamment après l’adoption de la Constitution fédérale et l’élection de Berne en tant que ville fédérale en 1848. Il s’agissait surtout de fonctionnaires fédéraux d’autres cantons, principalement catholiques, et de diplomates, mais aussi de migrants de l’Italie voisine.

Après que l’église Saint-Pierre-et-Paul, à l’origine premier édifice catholique, a été attribuée à l’église catholique chrétienne dans le cadre du Kulturkampf (combat pour la civilisation) dans la seconde moitié du XIXe siècle, des plans ont été réalisés pour construire une nouvelle église catholique, l’église de la Sainte-Trinité, inaugurée en 1899.

Aujourd’hui, l’Église catholique de la région de Berne, avec ses 14 paroisses et ses nombreuses communautés et missions en d’autres langues, est d’une diversité vivante. Par son engagement social, elle apporte une contribution importante à la cohabitation de toutes les personnes vivant à Berne.